自然科学研究科のキャンパスは南地区(本館、１・２・３号館)、中地区(5号館)と隣接する研究施設等で構成されています。地区内には自然科学系図書館や福利厚生施設（食堂、売店、コンビニ）、日替わりキッチンカーの出店があり、博士の皆さんが学びを深める後押しをする環境の充実を行っています。
また、キャンパスは今も発展を続けており、令和7年度は新施設の建設が進んでいます。